Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
EPCAMP16422 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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