Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRCP08575 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms