Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms