Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC092133.1-201ENST00000565828 719 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 Z98949.1-208ENST00000597614 816 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CT45A10-201ENST00000611668 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AP003068.4-201ENST00000623192 802 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 OR9K2-204ENST00000641374 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PPCS-204ENST00000372562 966 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC092952.1-201ENST00000397646 1209 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL591846.2-201ENST00000425161 358 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC000362.1-201ENST00000433725 425 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC02024-202ENST00000493545 483 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 NUMB-231ENST00000559312 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms