Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 OR52U1P-201ENST00000439752 923 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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