Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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CCDC96Q2M329 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CCDC96Q2M329 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CCDC96Q2M329 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CCDC96Q2M329 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CCDC96Q2M329 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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CCDC96Q2M329 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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