Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms