Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL512413.1-201ENST00000606489 382 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.72
SS18Q15532 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
SS18Q15532 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
SS18Q15532 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
SS18Q15532 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
SS18Q15532 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
SS18Q15532 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
SS18Q15532 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
SS18Q15532 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
SS18Q15532 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SS18Q15532 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms