Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC093283.1-201ENST00000565306 1075 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CDH17-202ENST00000441892 2204 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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