Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 CYP4A44P-201ENST00000569984 154 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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