Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC083843.1-201ENST00000521444 849 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CLEC7A-208ENST00000525605 573 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC108861.1-201ENST00000611634 585 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 VIT-203ENST00000389975 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CNPY1-204ENST00000636446 1637 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CRB1-210ENST00000538660 3397 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 USP40-203ENST00000427112 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CNTNAP4-202ENST00000377504 4723 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AMMECR1L-201ENST00000272647 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC005520.1-201ENST00000556551 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 WDR31-203ENST00000374195 3101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 DNAH9-215ENST00000608377 3147 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 OGFOD1P1-201ENST00000447552 1592 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 ZNF45-206ENST00000615985 2912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CYP1A1-205ENST00000564596 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 SKA2-203ENST00000578105 689 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC012370.2-202ENST00000600508 1099 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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