Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 HTR2A-201ENST00000378688 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 HRNR-201ENST00000368801 9623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP1-201ENST00000311956 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 DMBT1-203ENST00000344338 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 DMBT1-205ENST00000368955 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 TRIO-214ENST00000509967 4949 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SLC6A2-206ENST00000567238 3160 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RXFP1-207ENST00000470033 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC004148.2-201ENST00000575890 1938 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 FSD1L-202ENST00000374710 7664 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC008985.1-201ENST00000624169 2239 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SLC16A12-201ENST00000371790 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MYOM1-203ENST00000400569 4927 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 JAKMIP2-206ENST00000616793 9272 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CACYBP-209ENST00000613570 2835 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 IRF2-201ENST00000393593 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP208-201ENST00000365474 361 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 FCAR-205ENST00000391723 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ATP5J2-203ENST00000394186 305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC064874.1-201ENST00000409661 441 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC011747.1-201ENST00000425678 565 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL591438.2-201ENST00000452635 691 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL135908.1-202ENST00000454135 562 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC007731.3-201ENST00000458154 446 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC105345.2-201ENST00000515186 664 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP14-201ENST00000516000 329 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SRMP2-201ENST00000553832 916 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC006967.3-201ENST00000594086 1093 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL715P-201ENST00000606972 286 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC123788.2-201ENST00000612290 283 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 DET1-202ENST00000444300 2154 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ISX-201ENST00000308700 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC018880.1-201ENST00000418898 1319 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SCRN1-201ENST00000242059 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 IQUB-201ENST00000324698 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 PARP2-204ENST00000527915 1980 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC01105-204ENST00000444416 2695 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ENTPD5-201ENST00000334696 5842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 TMEM116-201ENST00000355445 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 HSD11B1-202ENST00000367027 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 NCAPH-202ENST00000427946 2363 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL157895.1-201ENST00000451713 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CSMD1-202ENST00000400186 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CSMD1-217ENST00000602723 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ZNF300P1-201ENST00000356555 1822 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 FBN2-203ENST00000507835 1884 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC091132.4-201ENST00000587960 2262 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 FANK1-201ENST00000368689 522 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC074117.1-203ENST00000412749 399 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC110995.1-202ENST00000422914 860 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SNHG17-204ENST00000423536 517 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms