Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC009108.1-201ENST00000473913 796 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 TMEM150C-203ENST00000508701 566 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 FAM41AY1-201ENST00000421205 906 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL021707.2-201ENST00000431924 786 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 FAM41AY2-201ENST00000458627 906 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC078929.1-201ENST00000547679 502 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 DNM1P47-201ENST00000560757 334 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ANKRD42Q8N9B4 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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