Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC6BQ86SZ2 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms