Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms