Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SP140Q13342 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SP140Q13342 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SP140Q13342 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SP140Q13342 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SP140Q13342 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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