Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 ST13P18-201ENST00000456632 1027 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
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MKRN3Q13064 RN7SL146P-201ENST00000472338 297 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
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MKRN3Q13064 TDG-202ENST00000392872 3251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 OR11G2-202ENST00000641682 3786 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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MKRN3Q13064 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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MKRN3Q13064 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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MKRN3Q13064 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL451054.3-201ENST00000611115 776 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 CU638689.4-203ENST00000625185 785 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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MKRN3Q13064 TPP2-202ENST00000376065 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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MKRN3Q13064 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 NBPF9-202ENST00000584027 5034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 DHX29-201ENST00000251636 4502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 TRIM52-205ENST00000611618 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 SEC24A-202ENST00000398844 6299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 TESK2-201ENST00000372084 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
MKRN3Q13064 LPAL2-205ENST00000639825 1536 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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