Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 ANGPT1-206ENST00000520734 1526 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FOXD4Q12950 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RNU1-38P-201ENST00000362817 144 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ARPP21-217ENST00000436702 561 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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