Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ACTBP60709 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACTBP60709 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACTBP60709 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACTBP60709 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACTBP60709 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACTBP60709 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACTBP60709 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACTBP60709 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACTBP60709 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACTBP60709 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACTBP60709 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ACTBP60709 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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ACTBP60709 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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ACTBP60709 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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ACTBP60709 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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ACTBP60709 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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ACTBP60709 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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ACTBP60709 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACTBP60709 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACTBP60709 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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