Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms