Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PRKCHP24723 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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