Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SCN11A-201ENST00000302328 6500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 TCF4-207ENST00000540999 2572 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 RAB5B-210ENST00000553116 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 IGSF22-205ENST00000513874 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ZNF665-201ENST00000396424 4159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 DUXAP8-204ENST00000447898 4136 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 SLC10A7-201ENST00000335472 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC145207.5-201ENST00000582866 2682 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AL353052.2-201ENST00000441459 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC107419.1-201ENST00000422048 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ZEB2-205ENST00000419938 1755 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC003684.1-201ENST00000432442 1715 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 PHLPP2-206ENST00000568954 8317 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC018880.1-201ENST00000418898 1319 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 FHL1-230ENST00000630084 1335 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 MYL6-201ENST00000293422 664 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 PROX1-AS1-201ENST00000413560 496 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC006455.4-201ENST00000418297 528 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AL049758.1-201ENST00000423154 397 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AL035045.1-201ENST00000425405 632 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 RPL12P4-201ENST00000432629 497 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 HBBP1-201ENST00000433329 439 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC073188.4-201ENST00000450077 528 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 VDAC1P5-201ENST00000603132 844 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
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PTPREP23469 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC244196.3-201ENST00000614171 374 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC006449.1-201ENST00000616263 571 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ARMC3-204ENST00000409983 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ZNF544-201ENST00000269829 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 GSPT1-206ENST00000563468 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPREP23469 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 OR8G1-202ENST00000641972 5055 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 CD86-201ENST00000264468 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 TDRD9-201ENST00000339063 3447 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ABCA9-202ENST00000453985 6116 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 GABRR1-202ENST00000435811 3106 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PTPREP23469 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
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