Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
SDSP20132 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SDSP20132 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SDSP20132 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms