Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
MSI1O43347 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
MSI1O43347 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
MSI1O43347 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
MSI1O43347 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
MSI1O43347 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
MSI1O43347 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
MSI1O43347 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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MSI1O43347 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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MSI1O43347 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
MSI1O43347 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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MSI1O43347 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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MSI1O43347 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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MSI1O43347 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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MSI1O43347 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
MSI1O43347 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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