Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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RFXAPO00287 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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RFXAPO00287 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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RFXAPO00287 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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RFXAPO00287 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 TCF4-246ENST00000570287 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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