Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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SGF29Q96ES7 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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SGF29Q96ES7 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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SGF29Q96ES7 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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SGF29Q96ES7 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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