Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 MTCO1P55-201ENST00000489829 745 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRRC38Q5VT99 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms