Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CCDC96Q2M329 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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CCDC96Q2M329 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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CCDC96Q2M329 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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CCDC96Q2M329 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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CCDC96Q2M329 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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CCDC96Q2M329 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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CCDC96Q2M329 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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CCDC96Q2M329 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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CCDC96Q2M329 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC96Q2M329 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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