Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 ZNF655-222ENST00000493277 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 IL37-203ENST00000349806 589 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL162724.2-201ENST00000426157 308 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL590729.1-201ENST00000427046 573 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC068137.1-201ENST00000429272 584 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 ARL17B-201ENST00000434041 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 ARL17A-203ENST00000445552 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC016683.1-201ENST00000446590 559 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC107956.2-201ENST00000496042 454 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC110760.2-202ENST00000507517 946 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 LINC01184-206ENST00000508878 968 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 C11orf70-205ENST00000534360 520 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL050343.1-203ENST00000586761 1290 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC008592.5-201ENST00000607856 547 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 CT45A8-202ENST00000611660 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 CT45A10-201ENST00000611668 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 CT45A2-202ENST00000612907 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 CT45A9-202ENST00000620704 1010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL353608.4-201ENST00000624487 1188 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms