Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
TAF1AQ15573 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms