Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC099777.1-201ENST00000603779 1070 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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SYCP1Q15431 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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SYCP1Q15431 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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SYCP1Q15431 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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