Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms