Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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