Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CUL3Q13618 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SETP22-201ENST00000412243 957 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms