Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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