Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms