Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 ZNF410-205ENST00000442160 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SREBF2Q12772 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SREBF2Q12772 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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