Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPIBQ01892 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms