Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F1Q01094 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms