Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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SH3BP1Q9Y3L3 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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SH3BP1Q9Y3L3 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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SH3BP1Q9Y3L3 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
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