Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

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Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HPS3Q969F9 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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