Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 AC103719.1-201ENST00000517994 581 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 LINC01606-206ENST00000520929 411 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 OR1D4-201ENST00000525719 939 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 RAB19-203ENST00000537763 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 LINC02454-202ENST00000541391 612 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC137055.1-201ENST00000549333 395 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC079313.2-202ENST00000552053 511 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 DDIT3-205ENST00000552740 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC048337.1-201ENST00000557474 552 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 OR1D5-201ENST00000575751 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC010761.2-202ENST00000582536 391 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 MIR8078-201ENST00000619811 84 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 SNHG5-218ENST00000623901 711 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 BCAS3-233ENST00000626960 227 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 OLMALINC-206ENST00000641799 1195 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 CEP95-201ENST00000553412 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 ASIC5-201ENST00000537611 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 FCGR2A-202ENST00000367972 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AL137782.1-201ENST00000563635 4128 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 GALNTL5-201ENST00000392800 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 GPD2-203ENST00000409674 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 MAPK10-233ENST00000515650 2394 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 MPEG1-201ENST00000361050 4442 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC016722.2-201ENST00000429761 1835 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 ADA2-202ENST00000330232 3195 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 ZIM3-201ENST00000269834 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 GSG1-203ENST00000396302 1628 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 CNPY1-204ENST00000636446 1637 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 OR51D1-201ENST00000357605 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 TDRKH-AS1-201ENST00000389897 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 MIR1208-201ENST00000408334 73 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 RNA5SP221-201ENST00000411271 103 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 E2F4P1-201ENST00000422443 1133 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 RALY-AS1-202ENST00000432859 610 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AL136982.6-201ENST00000444180 1238 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AL512353.1-203ENST00000444563 610 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AL606468.1-201ENST00000444750 510 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 NEURL1-AS1-201ENST00000447820 439 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 784 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AL683842.1-201ENST00000455505 525 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 RPS10P16-201ENST00000483812 496 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC106872.7-201ENST00000508621 312 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 DKK2-202ENST00000510463 908 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC068134.3-201ENST00000513620 788 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 HMMR-AS1-201ENST00000514724 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SVOPQ8N4V2 AC087354.1-201ENST00000522373 1037 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms