Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms