Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AOX1-202ENST00000374700 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF275-202ENST00000370251 6320 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AP4S1-211ENST00000616371 4595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PIEZO2-202ENST00000383408 9718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RBM7-204ENST00000541475 6725 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CASC15-203ENST00000605917 4461 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC090983.1-201ENST00000623426 3897 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PLEKHA5-213ENST00000538714 6487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CEP128-209ENST00000555265 4662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF473-202ENST00000391821 4715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ATP2B2-204ENST00000397077 8964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SLC9A6-207ENST00000636092 4697 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DNAJC27-AS1-205ENST00000434897 4660 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 WDR31-202ENST00000374193 4878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF83-211ENST00000597597 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 INTS7-201ENST00000366992 3380 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LY75-CD302-202ENST00000505052 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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