Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AP003066.1-201ENST00000527528 1647 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC012291.1-201ENST00000559666 429 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 THSD4-AS1-204ENST00000566268 468 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC008734.1-201ENST00000594006 537 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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