Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 354.9 ms