Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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PGGT1BP53609 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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PGGT1BP53609 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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PGGT1BP53609 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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