Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms