Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms