Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
MLH3Q9UHC1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms